Group-DIA: analyzing multiple data-independent acquisition mass spectrometry data files
本研究开发了一种高效的数据非依赖性采集（DIA）质谱数据分析方法——Group-DIA，能够同时分析多个DIA数据文件，显著提高了大规模蛋白质组学研究的效率和准确性。该方法已应用于多项重要生物医学研究。
SCASP: A Simple and Robust SDS-Aided Sample Preparation Method for Proteomic Research
开发了一种简单而稳健的SDS辅助样品制备方法（SCASP），大幅简化了蛋白质组学研究中的样品处理流程，提高了样品制备的重复性和成功率，为大规模蛋白质组学研究提供了可靠的技术支持。
Investigation of Effects of the Spectral Library on Analysis of diaPASEF Data
深入研究了光谱库对diaPASEF数据分析效果的影响，为优化DIA-PASEF技术的数据分析策略提供了重要指导，提高了定量蛋白质组学分析的准确性和深度。
Evaluation of DDA Library-Free Strategies for Phosphoproteomics and Ubiquitinomics Data-Independent Acquisition Data
系统评估了多种DDA无文库策略在磷酸化蛋白质组学和泛素化蛋白质组学DIA数据分析中的应用效果，为翻译后修饰蛋白质组学研究提供了重要的方法学参考。
Comprehensive PTM profiling with SCASP-PTM uncovers mechanisms of p62 degradation and ALDOA-mediated tumor progression
利用SCASP-PTM技术进行全面的翻译后修饰谱分析，揭示了p62降解和ALDOA介导的肿瘤进展机制，为癌症研究和治疗提供了新的见解和潜在靶点。
Protocol for tandem enrichment of ubiquitinated, phosphorylated, and glycosylated peptides with SCASP-PTM
建立了一套完整的实验流程，实现了泛素化、磷酸化和糖基化肽段的串联富集，为多维翻译后修饰研究提供了标准化的操作指南和可靠的实验方法。